各个级别的东莞无尘车间应用如下
　　十万级无尘车间：十万级无尘车间可用于很多的工业部门，比如光学产品的制造，用于较小的元器件制造大型的电子系统，液压或气压系统的制造，食品饮料的生产，医、药工业也常常使用这一级无尘车间。
　　万级无尘车间：万级无尘车间常用于液压设备或气压设备的装配，某些情况下也用于食品饮料工业，此外，万级无尘车间在医工业中也很常用。
　　千级无尘车间：这个级别的东莞无尘车间主要用于高质量光学产品的生产，还用于测试，装配飞机蛇螺仪，装配高质微型轴承等。
　　百级无尘车间：百级无尘车间可用于医药工业的无菌制造工艺等，这一级别无尘车间大量应用于植入体内物品的制造，如外科手术，包括移植手术，集成器的制造，那些对细菌感染特别敏感的病人的隔离治疗，比如像骨髓移植病人术后的隔离治疗。